K nevôli konzília odborníkov, ktorí navrhovali, aby boli v rámci lockdownu zatvorené školy, nedošlo k plošnému zrušeniu prezenčnej výučby. Dôvodom je silný odpor zo strany SaS, ktorá je presvedčená, že školská dochádzka je napriek pandémii stále pomerne bezpečná a nechať deti doma by sa výrazne podpísalo na ich vedomostiach. Školy sa teda zatiaľ zatvárajú len individuálne – právomoc o tomto rozhodnutí je v rukách regionálneho hygienika.

Minister školstva Branislav Gröhling tvrdí, že v školách prebieha intenzívny zber dát a vďaka tomu je možné v prípade výskytu nakazeného žiaka rýchlo zareagovať a do karantény zaviesť len jeho triedu bez toho, aby bolo prerušené vyučovanie v celej škole. Veľa žiakov sa aj napriek tomu necíti v bezpečí a myslí si, že v takejto vážnej situácii sú tieto opatrenia nedostatočné.